只要是喜欢看《名侦探柯南》的童鞋们应该都会对黑衣组织比较感兴趣，对于黑衣组织幕后的BOSS更是有许多猜测，所以笔者也大胆地说出自己的推理，当然这也仅仅只是笔者的推理，所有的真相都在青山刚昌这家伙的脑子里。

网络上其实有很多这方面的猜测。第一种猜测是指最终BOSS是阿笠博士，可怜的阿笠博士不知招惹谁了，竟然成了反派，这种猜测肯定是错误的，首先这种猜测说阿笠博士的名字来源于莫里亚蒂教授，但事实上阿笠博士的名字是来源于阿加莎·克里斯蒂，而第一部剧场版《引爆摩天楼》中的森谷帝二的名字才是来源于莫里亚蒂，同样的来源青山刚昌不会用第二次。还有在第十部剧场版《侦探们的镇魂歌》中，在炸弹还有1秒都不到的时间就要爆炸的时候，阿笠博士依然陪伴在那些孩子们的身边，能够影响世界的黑衣组织的首脑会做这样的自我牺牲吗？所以这种猜测是错误的。

第二种猜测是指最终BOSS是日本前首相，这种猜测其实非常可笑，能够引起美国中央情报局和联邦调查局的关注的组织，其首脑可能只是区区一个日本首相吗？如果是美国总统还说得过去，而且组织的首脑毕竟是反派的角色，作为日本人的青山刚昌会给自己国家抹黑？这样想想这种猜测是说不过去的。

那么组织的首脑会是谁呢？

笔者认为黑衣组织的首脑是一个不存在的人，即使一个死人！读者肯定要问如果是一个死人，那他是如何给琴酒等人下达命令的？恐怕这要引入人工智能了，人工智能并非是不存在的，在第六部剧场版《贝克街的亡灵》里已经出现过人工智能了，所以这也是可以实现的。

那么组织的目的又是什么呢？

在“板仓卓事件”里疑似贝尔摩德的女子说过这样的话：“We can be both of God and the Devil. Since we are trying to raise the dead against the stream of time.”用中文来说就是“我们既是神也是恶魔，因为我们要令时光倒流，让人起死回生。”这是很有参考价值的话，也许黑衣组织的目的正是要让首脑复活！做个更大胆的猜测，APTX4869就是试验品，虽然没有起死回生，但确实在某种意义上做到了时光倒流。当然这也仅是猜测，证据并不充分。

以上就是我的推理，欢迎各位与我交流！